高通量测序分析肝移植急性排斥反应相关 基因单核苷酸多态性位点的突变
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高通量测序分析肝移植急性排斥反应相关 基因单核苷酸多态性位点的突变

High-throughput sequencing analysis of single nucleotide polymorphism loci mutation in genes associated with acute rejection in liver transplantation

鲍远大 易述红

Bao Yuanda, Yi Shuhong

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引用本文:

【摘要】 目的 利用高通量测序分析肝移植术后急性排斥反应相关度最高的基因单核苷酸多态性(SNP)
位点的突变情况。 方法 收集同种异体原位肝移植术的 68 例受体外周血样本,根据有否发生急性排斥反应分为
急性排斥组(13 例)和非排斥组(55 例)。通过查阅文献,最终确定与排斥反应发生相关的 44 个 SNP 突变位点。
以 44 个 SNP 位点作为检测靶点,用高通量测序分析对两组受体外周血样本进行检测,经生物信息学分析出与急
性排斥反应发生相关基因 SNP 位点的突变率。 结果 急性排斥组中的白细胞介素(IL)-10 TT 基因型、 T 等位基因、
AA 基因型、 A 等位基因的 SNP 位点突变率明显高于非排斥组;急性排斥组中的细胞趋化因子受体(CCR5
AG 基因型的 SNP 位点突变率明显低于非排斥组, CCR5 GG 基因型的 SNP 位点突变率明显高于非排斥组;急性
排斥组中的 IL-4 CT 基因型的 SNP 位点突变率明显高于非排斥组, IL-4 TT 基因型的 SNP 位点突变率明显低于非
排斥组;急性排斥组中核因子 -κB 抑制因子 α(NF-κBIA) C 等位基因的 SNP 位点突变率明显高于非排斥组;急
性排斥组中维生素 D 受体(VDR) CC 基因型和 C 等位基因的 SNP 位点突变率明显低于非排斥组,差异均有统计
学意义(均为 P<0.05)。 结论 高通量测序分析发现肝移植术后急性排斥反应相关基因中,其 SNP 位点突变率
较高的包括 IL-10 TT 基因型、 T 等位基因、 AA 基因型、 A 等位基因, CCR5 GG 基因型、 AG 基因型, IL-4 CT 基
因型、 TT 基因型, NF-κBIA C 等位基因, VDR CC 基因型和 C 等位基因。

关键词: 肝移植;急性排斥反应;高通量测序;单核苷酸多态性(SNP);白细胞介素;细胞趋化因子受体; 核因子 -κB 抑制因子 α;维生素 D 受体;基因突变

中图分类号: R617, R318.04

基金资助: 广东省自然科学基金(2016A030313224);广东省省级产业技术研究与开发专项资金项目(20169013)

作者单位: 510630 广州,中山大学附属第三医院肝脏外科暨肝移植中心

作者简介: 鲍远大,男, 1992 年生,硕士研究生,研究方向为肝移植, Email:1013261488@qq.com

收稿日期: 2018-05-10

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